Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
小天患上了少女麻疹，所谓少女麻疹，是一种只在外星男性身上才会出现的疾病，主要症状就是双眼会变成少女漫画中那样水汪汪的大眼睛。小天害怕打针，于是四处躲藏，结果被阿当捉了回来。由于有过身体接触，阿当也被少女麻疹所传染，虽然打针后暂时稳定了下来，不过还是有复发的可能。阿当难耐寂寞，趁拉姆不注意跑了出去。虽然少女麻疹不会传给女性，但难免会和男性接触，暖炉猫跟面堂相继成为阿当的受害者。拉姆一心抓住四处乱跑的阿当，却由此在友引商业街引发更大的混乱……本片根据高桥留美子同名漫画改编，为该系列的OVA作品。
曾为魔王 · 织田信长爱刀的四名刀剑男士，他们将在织田信长被刺杀的本能寺之变出阵。在纷乱之中，他们需要保护的历史是什么？他们的使命又是什么？ 一个在循环在历史中寻找起源的物语，现在开始。
問題學生山田龍因為意外與優等生白石麗接吻，導致兩人的身分對調！陸續發生問題、充滿快樂、由接吻拉開序幕的校園愛情喜劇，開課了！
表面看来，砂户太郎（福山润 配音）不过是一介普通少年，但在那人畜无害的面孔之下，隐藏着极为扭曲的个性，没错，砂户太郎是那种一旦被女性粗暴对待就会兴奋的浑身发抖的超级受虐狂！砂户太郎一直深深爱恋着被称为“志穗璃公主”（佐藤利奈 配音）的神秘女子，为了成为能够配得上公主的人，砂户太郎决定好好的进行一番自我修炼，就这样，他来到了传说中能够实现愿望的第二义工社。迎接砂户太郎的，是名为石动美绪（竹达彩奈 配音）的金发女子，在她娇俏可人的外表之下，隐藏着专横跋扈残暴无理的一面。此外还有外冷内热的紫发少女结野岚子（早见沙织 配音），在一连串匪夷所思的意外事件之后，砂户太郎对于自己是否真的能够完成心愿产生了深深的怀疑。
在这个科技飞速发展的时代里，想要解读人类脑中残留的影像早已不是一件难题，一个专门利用此项技术侦破案件的组织——第九研究室应运而生。在室长薪刚（关智一 配音）的带领下，身强体壮的青木一行（浪川大辅配音）、心理学者天地奈奈子（野中蓝 配音）等精明强干的队员们利用各自的能力破解着一桩又一桩扑朔迷离的案件。虽然技术让破案变得更加迅速和简单，但其中涉及到的有关隐私和权利的部分一直都处在道德的灰色地带。同时，每日面对着被害者死前目击到的残酷影像，要如何在工作和生活之间划上清晰的分界线也成了组员们要面对的一大难题。
1990年2月神户市北区俄勒冈村在孤儿院生活的双胞胎少年米奇与达利，有一天被富裕而安详的老夫妇园山夫妻收为了养子。但他们并非以「米奇」与「达利」两位少年的身份，而是以「园山秘鸟」这一位少年的身份被收养的。二人隐瞒了真实身份，在扮演园山秘鸟的同时融入俄勒冈村。二人究竟为何要扮演同一个人？其中包含着巨大的秘密和惊人的目的。
田中（小野贤章 配音）是1-F班的学生，身体孱弱的他长着一副宛如女孩子般的秀气面孔，讲起话来亦细声细语，还常常讲到一半就因为体力不支而睡着。无论何时，田中都是一副迷迷糊糊的困倦模样，生活中任何麻烦的事情都和他无缘。长相有些凶恶的太田（细谷佳正 配音）常常被人误认为是不良少年，但实际上，他却担任着田中身边“保姆”的职责，在生活之中对他照顾有加并且乐在其中。活泼开朗的元气少女宫野（高森奈津美 配音）一直暗恋着大姐头越前（诹访彩花 配音），为了能够成为和越前相配的同伴，宫野拜了田中为师，向他学习稳重慵懒之道。充满了欢乐的日常就此展开。
