近未来的日本，一个叫做“疏濑”的城市中，市民过着平凡的生活，只不过，在城市的一角，山冈上面耸立着医疗机器制造厂建造的外形酷似熨斗的工厂，每天固定时刻，那个工厂都像刚烫完东西一样散发出大量蒸汽。小学6年级学生直太，与高中女生真见美，直太那个留学的哥哥的女友，一起在河边打发时间。本该是继续平凡的日子，随着传说中的蜜蜂女——睛子驾驶的电车撞上直太而结束了。直太头上长出了奇怪的角！而睛子居然成为直太家的佣人进入了直太家。睛子的秘密与她口中常念起的“FLCL”的含义，令直太的生活有了翻天覆地的改变。
故事讲述无聊的神明们制作了一个终极益智游戏《诸神的游戏》，从冰里长眠3000年，热爱游戏的前神明少女レオレーシェ苏醒后做出宣言，「带上这个时代最会玩的人！」，而被指名的フェイ是备受期待成为「近年最强的新人」的使徒，两人共同挑战难度极大且还没有人类能完全攻略的《诸神的游戏》。天才游戏少年、前神明少女与伙伴们就此展开和至高神明的终极脑力大战！
故事发生在一个名叫纳特拉的王国之中，王子维恩（齐藤壮马 配音）在父亲病倒之后，终于独自一人肩负起了治理整个国家的重任。纳特拉实在是太过于弱小了，每天都在遭受周边强国的霸凌和侵略，维恩既没有足够的钱来整顿内政，有没有足够的战力去侵略掠夺别国资源，慢慢的，国内的人才纷纷流落到了其他国家之中。而维恩最大的愿望，就是能够早日卖掉自己的国家，过上闲散的生活。辅佐官妮妮姆（高桥李依 配音）和王国公主芙拉妮雅（千本木彩花 配音）一直陪伴在维恩的身边，辅佐着他，可即便如此，现在的工作对于维恩来说还是太超过了。“只要讨好大国，卖掉这个国家就能实现他的梦想了”，弱小王子的国家经营故事就此拉开了序幕。
东京郊外的街道——天鹅绒町，这里有着被剧团成员们称之为天鹅绒之路的圣地。身为原舞台演员、因一纸来信而站在此地的你，将会遇到的是……负债累累！没有客人！团员只有一位！失去过去辉煌即将倒闭的落魄剧团！因机缘巧合，你成为了剧团的团长兼【总监督】，身负把剧团重整起来的重任？
时值1980年代，江之岛的小学四年级的女生铃音凛（鈴音リン）父母双亡，她独自经营着食堂生活下去。
